儒家思想也是中国本土思想，并非外来文化，与道教的宇宙哲学观念基本相同，由汉代谶纬神学；如俞琰（易外别传）引证邵雍、朱熹等人之言论来叙述内丹，李道纯内丹学以周易卦象为密意，儒书所说的致中和为内炼要旨；在道德修养的创教开始即和会儒家思想，所以儒道不分。